Tugas
Melaksanakan pengelolaan dan pelayanan pemanfaatan sumberdaya ikan, serta keselamatan operasional kapal perikanan.

Fungsi
1. penyusunan, pemantauan, dan evaluasi rencana, program, dan anggaran, serta pelaporan dibidang pelabuhan perikanan;
2. pelaksanaan pengaturan keberangkatan, kedatangan, dan keberadaan kapal perikanan di pelabuhan perikanan; 
3. pelaksanaan pelayanan penerbitan surat tanda bukti lapor kedatangan dan keberangkatan kapal perikanan; 
4. pelaksanaan pemeriksaan logbook penangkapan ikan; 
5. pelaksanaan pelayanan penerbitan persetujuan berlayar; 
6. pelaksanaan penerbitan sertifikat hasil tangkapan ikan; 
7. pelaksanaan pengawasan pengisian bahan bakar;
8. pelaksanaan pembangunan, pengembangan, pemeliharaan, pendayagunaan, dan pengawasan, serta pengendalian sarana dan prasarana; 
9. pelaksanaan fasilitasi penyuluhan, pengawasan dan pengendalian sumber daya ikan, perkarantinaan ikan, publikasi hasil penelitian, pemantauan wilayah pesisir, wisata bahari, pembinaan mutu, serta pengolahan, pemasaran, dan distribusi hasil perikanan; 
10. pelayanan jasa, pemanfaatan lahan, dan fasilitas usaha; 
11. pelaksanaan pengumpulan data, informasi, dan publikasi; 
12. pelaksanaan bimbingan teknis dan penerbitan sertifikat cara penanganan ikan yang baik; 
13. pelaksanaan inspeksi pengendalian mutu hasil perikanan pada kegiatan penangkapan ikan; 
14. pelaksanaan pengendalian lingkungan di pelabuhan perikanan; dan 
pelaksanaan urusan ketatausahaan.