Berdasarkan hasil pengukuran melalui aplikasi kinerjaku.kkp.go.id, BBRSEKP berhasil mencatatkan capaian kinerja yang sangat signifikan. Total skor capaian kinerja lembaga pada akhir tahun 2025 menyentuh angka 116,34%. Angka ini menempatkan BBRSEKP pada kategori predikat kinerja "ISTIMEWA".

Pencapaian luar biasa ini didukung oleh pemenuhan 9 Indikator Kinerja (IK) yang telah ditetapkan dalam Perjanjian Kinerja tahun 2025. Dari total indikator tersebut, sebanyak 6 IK mendapatkan status istimewa dan 3 IK berstatus baik. Rincian capaian 9 IK tersebut adalah:

1. Rekomendasi dan/atau model pemberdayaan sosial ekonomi kelautan dan perikanan dengan target 1 paket dan capaian sebesar 2 paket atau sama dengan 120%.
2. Indeks profesionalitas ASN BBRSEKP dengan target indeks sebesar 76 dan capaian sebesar 93,80 atau sama dengan 120%.
3. Penilaian keterbukaan informasi BBRSEKP dengan target nilai sebesar 85 dan capaian sebesar 95,40 atau sama dengan 112,24%.
4. Nilai IKPA BBRSEKP dengan target sebesar 92 dan capaian sebesar 99,35 atau sama dengan 107,99%.
5. Nilai kinerja perencanaan anggaran BBRSEKP dengan target nilai sebesar 71,5 dan capaian sebsar 100 atau sama dengan 120%.
6. Penilaian mandiri SAKIP BBRSEKP dengan target 82 dan capaian sebesar 84 atau sama dengan 102,44%.
7. Persentase rekomendasi hasil pengawasan yang dimanfaatkan untuk perbaikan kinerja BBRSEKP dengan target sebesar 85% dan capaian sebesar 85% atau sama dengan 100%.
8. Persentase rencana umum pengadaan PBJ yang diumumkan pada SIRUP BBRSEKP dengan target sebesar 80% dan capaian sebesar 100% atau sama dengan 120%.
9. Tingkat kepatuhan pengelolaan BMN BBRSEKP dengan target sebesar 80% dan capaian sebesar 95% atau sama dengan 118,75%.

Capaian kinerja "ISTIMEWA" ini menunjukkan bahwa dalam pelaksanaan program kerja, BBRSEKP telah menjalankan tata kelola organisasi yang efektif, terukur, dan berorientasi hasil. Keberhasilan ini tidak hanya mencerminkan kuatnya sistem manajemen yang diterapkan, tetapi juga menunjukkan keselarasan antara perencanaan, pelaksanaan, pengendalian, dan evaluasi kinerja di seluruh lini organisasi.